TESTS GENETIQUES

APPAN et Recherche Génétique : Passé-Présent-Avenir .
L’une des deux missions de l’APPAN est la préservation de l’Abeille Noire Locale . A ce titre on
peut concevoir cette mission sur le principe suivant :
– Détenir des souches d’Abeilles noires Locales pures et s’attacher à les préserver sur des ruchers
dont on a pu déterminer la qualité intrinsèque de la reproduction naturelle de nos Abeilles et ainsi d’
être en mesure de distribuer des essaims et des Reines dont l’origine et la fécondation sont
garanties .
Les moyens à mettre en œuvre sont multiples et variés , la liste non-exhaustive serait :
-Procéder à des tests génétiques permettant de faire le tri des colonies en place sur des critères de
pureté mais aussi de qualité de production de miel, de praticabilté, de résistance au Varrroa , etc …..
-Déterminer sur le territoire de l’Association des secteurs sur lesquels la fécondation naturelle des
reines est encore bonne , sachant que la pression de l’abeille jaune menace de jours en jours la
qualité de cette fécondation naturelle et que nous serons contraints de vérifier régulièrement ce
dernier paramètre .
-Envisager des solutions qui dans un futur , sans doute très proche , nous serons imposées pour
garantir la conservation de nos souches pures :
-Fécondation de nos reines sélectionnées par nos bourdons sélectionnés sur des territoires
garantissant l’exclusivité de cette fécondation .
-Mettre en place et généraliser le processus d’insémination artificielle .
Tout est question au sein de l’Association de priorités à déterminer, de moyens financiers à trouver
et ………d’investissements personnels .
Passé :
En fin 2019, Dominique LE DOARE et son équipe ont procédé à des tests Phénotypes APICLASS ,
(test morphométrique des ailes d’abeilles), qui ont été confirmés par des tests Génétiques de type
microsattelites avec recherche de 117 marqueurs génétiques, sur 22 ruches préalablement
sélectionnées par APICLASS . Ces tests ont permis de déterminer 16 ruches proches de 100 % avec
un génome pur . 4 ruches à 98 % , 2 ruches inférieures à 95 % et une ruche hors norme . Ces
derniers tests ( relativement coûteux ) garantissant le patrimoine génétique et la qualité de
fécondation de la reine . A partir de ces résultats , l’Association a pu distribuer des cellules royales
et des essaims dont l’Association était en mesure de garantir la pureté .
Exemple d’analyse d’aile d’abeille
La pression de l’abeille jaune nous incitait cependant à envisager une nouvelle série de tests . Il est
important de comprendre que la complémentarité des tests phénotypes et des test génétiques
( microsatellites ou mitochondriaux) est primordiale . Les premiers permettant de faire , à moindre
coût ( investissement personnel important en temps) , un premier tri des souches qui mériteront
l’investissement financier des seconds .
Présent :
L’accès au logiciel APICLASS s’étant arrêté , Dominique LE DOARE nous a proposé de procéder à
des tests mitochondriaux ( analyse du seul patrimoine génétique de la reine) à des prix
compétitifs .Nous vous avons proposé alors de faire tester vos abeilles, le premier test étant
« offert » par l’APPAN .Vous avez été une quarantaine à nous confier des échantillons de vos
abeilles . Cette approche supposait des tests en masse et non des tests individuels qui n’ont , et j’y
reviendrai plus loin , aucune valeur d’interprétation . Pour des raisons indépendantes de notre
volonté , les tests prévus n’ont pu être effectués, la personne qui devait effectuer ces tests ayant des
problèmes de santé et l’échéance de rendu des résultats étant reportée à fin 2023.
Depuis le départ de Dominique, avec David GOYAT nous avons pris en charge le groupe de travail
Génétique et David ayant découvert l’éxistence d’un nouveau logiciel du type APICLASS , (mais
en mieux) , nous nous sommes lancés dans la découverte de ce nouveau logiciel d’analyse type
morphotype d’aile d’abeilles : DEEPWINGS . Logiciel en accès libre , né en juillet 2022.
Ce logiciel présente l’avantage de pouvoir soumettre un lot d’abeilles ( jusqu’ à 40) provenant d’une
même ruche et d’établir un pourcentage de chance que votre ruche appartienne à une lignée
Meliféra pure . ATTENTION : ne pas confondre cela avec un taux de pureté !
Exemple de résultat d’analyse d’une onzaine d’abeilles par DEEPWINGS :
Excellente , si l’on fait abstraction de la ligne 22,1,O8,9 qui fait apparaître une hybridation : M
Mellifera à 88,04504 %+ M Carnica à 11,889324 % : Prévoir une analyse complémentaire !
Dominique ayant eu la gentillesse de me former à la réalisation de ce type de test et surtout à
l’interprétation, parfois complexe des résultats , je me suis fait la main en testant les échantillons
que vous nous aviez confiés . Sur les 62 ailes interprétables , le logiciel DEEPWINGS nous
confirme qu’à condition de supposer que toutes ces abeilles proviendraient de la même ruche que
notre Abeille Noire a 98,707117 % de chances d’appartenir à la souche M Iberienis . Rien
d’inquiétant, c’est bien une abeille noire qui est remontée en Bretagne depuis l’Espagne à la suite de
la dernière glaciation et que l’on retrouve également à GROIX et à OUESSANT !
Présente en Bretagne depuis environ 13 000 ans , on peut décemment la considérer comme locale .
Exemple de résultat d’analyse d’une quarantaine d’abeilles par DEEPWINGS :
Bien sûr nous avons aussi , à titre individuel de la M. Mellifera à 99,99426 % mais également une
O.Caucassica à 98,16853 % ou une M.Iberiensis à 77,58840+ M.Ligustica à 22,116970 % : S’il
s’agissait de 40 abeilles d’une même ruche , malgré le bon taux moyen , cette ruche ne pourrait être
retenue pour un futur greffage !
Les résultats individuels vous seront transmis individuellement , mais comme cité plus haut , ces
résultats n’ont aucune valeur d’interprétation puisque basés sur l’analyse d’une seule abeille par
ruche. D’autant plus qu’il y a fort à parier que lors du prélèvement votre choix s’est intuitivement
porté sur la petite abeille toute noire plutôt que sur sa voisine au premier segment d’abdomen
jaune !
Ces résultats devront être confirmés , ou non , par un test sur un lot d’au moins une quinzaine
d’abeilles par ruche .Pour information, cela représente environ 1 heure de travail par lot d’abeilles
donc , par ruche . Ces résultats permettront d’éliminer les colonies à taux d’hybridation trop
important , de sélectionner les colonies candidates au greffage , après confirmation des tests
génétiques et peut être de découvrir au sein de vos ruchers des colonies méritant d’être conservées
et dupliquées .
David pour sa part s’est chargé de tester les colonies des deux ruchers de l’association , sur la base
d’une douzaine d’abeilles par ruche . Il vous fera part de ses résultats lors de la prochaine assemblée
générale . L’analyse de ces résultats devra faire l’objet de décisions qui seront prises par le bureau
2023 de l’association . Dans un second temps , il nous faudra tester les essaims .
Avenir :
Nous validons , Dominique , David et moi le logiciel DEEPWINGS . La première publication
scientifique de son utilisation ( voir bibliographie) mettant en évidence une précision plus accrue
sur la détection d’abeilles de la lignée C par rapport à la lignée M , notre attention se portera plus
sur la présence de cette lignée C que sur la pureté de la M pour procéder aux choix à faire quant à
l’avenir de certaines de nos Reines !
Grace à celui-ci , en mettant en place une procédure de test à grande échelle, nous devrions
pouvoir :
– Tester la qualité de la fécondation des ruchers de l’association et de vos ruchers personnels .
– Dresser un état des lieux quant au taux d’hybridation des nos colonies .
– Établir celles de nos colonies qui méritent d’être testées génétiquement pour validation de nos
futurs greffages .
-Proposer aux adhérents de l’APPAN des essaims et des reines certifiés issu de souches locales
pures .
-Proposer à ceux d’entre vous qui le souhaiteraient une convention qui stipulerait des conditions de
testage de vos colonies par l’Association qui se verrait accorder la possibilité de greffer à partir des
colonies que l’Association aurait retenues .
Co-animateurs du groupe de travail Génétique au sein de l’APPAN , David et moi proposerons au
bureau 2023 de l’association un certains nombres de pistes .
Nous aurons besoin , pour mener à bien cette mission ,de l’expertise en matière de génétique de
Dominique LE DOARE dont nous souhaitons ardemment le retour au sein de notre bureau .
Nous aurons aussi besoin de toutes les bonnes volontés qui souhaitent se joindre à cet ambitieux
projet , l’acquisition d’un scanner+ordinateur sera étudié s’il s’avère nécessaire .
Pour ma part, conscient que l’avenir de nos souches Noires pures passera inévitablement , à court
ou moyen terme par l’insémination artificielle , j’ai décidé de me former à cette pratique sur mes
deniers personnels , ainsi j’ai espoir de pouvoir seconder David à ……..terme !
Ne pouvant être présent , pour raisons personnelles , à la prochaine assemblée générale, je vous
souhaite à Toutes et Tous une bonne année 2023 , tant sur le plan personnel qu’apicole !
Cordialement .
Philippe CHEVREL
Vice Président de l’APPAN
Co Animateur du groupe de travail Génétique .
PS : Bien évidement je me tiens à la disposition de Toutes celles et de Tous ceux d’entre vous qui
souhaiteraient des informations complémentaires .
Bibliographie :
Using the Software DeepWings© to Classify Honey Bees across Europe through Wing
Geometric Morphometrics
Carlos Ariel Yadró García 1,2 , Pedro João Rodrigues 2,3 , Adam Tofilski 4 , Dylan Elen 5,6 , Grace
P. McCormak 7 , Andrzej Oleksa 8 , Dora Henriques 1,2, Rustem Ilyasov 9 , Anatoly Kartashev 10 ,
Christian Bargain 11, Balser Fried 12 and Maria Alice Pinto 1,2,* 1 Centro de Investigação de
Montanha, Instituto Politécnico de Bragança, Campus de Santa Apolóni